v2.11.0 (5596)

Programme d'approfondissement - MDC_52P88_EP : Projet en bioinformatique

Domaine > Biologie, Informatique.

Descriptif

Projet en bioinformatique

Ce module correspond à un projet de recherche individuel ou en petit groupe effectué en association avec un chercheur. Les élèves découvrent un problème biologique à travers un travail de modélisation ou simulation.
Ils acquièrent de nouvelles connaissances tout en mettant en pratique les concepts de cours.
Le langage de programmation Python est utilisé, en particulier la librairie Biopython.

 

Niveau requis : Au moins un module de biologie en année 2
Langue du cours
: Français

Objectifs pédagogiques

Les sujets abordés comprennent l'analyse, la prédiction et l'ingénierie des séquences et des structures de protéines et d'ADN/ARN.
Chaque semaine, le point sur l'avancement des travaux est fait avec les Enseignants.

Format des notes

Numérique sur 20

Littérale/grade réduit

Pour les étudiants du diplôme M1 BH - Biologie et Santé

Vos modalités d'acquisition :

Il vous est demandé de faire une présentation par groupe des deux projets pendant 20/30min en simple/double. Vous pouvez organiser librement le temps de parole au sein d'un groupe et entre les projets.
- Vous aurez ensuite 10/15min (simples/doubles) de questions.
- Aucun rapport écrit n'est prévu mais nous vous demandons de nous envoyer les slides et codes de présentation par mail.
Les codes doivent être accompagnés d'exemples d'exécution préprogrammés (par exemple : python example_1.py, sans qu'il soit nécessaire de saisir des paramètres).

 

Pour les étudiants du diplôme Titre d’Ingénieur diplômé de l’École polytechnique

Vos modalités d'acquisition :

Examen oral.
Vous pouvez organiser librement le temps de parole au sein d'un groupe et entre les projets.
Vous disposerez ensuite de 10/15min (simple/double) de questions.
Aucun rapport écrit n'est attendu mais nous vous demandons de nous faire parvenir les slides et codes de présentation par email la veille de votre oral avant midi. Les codes doivent être accompagnés d'exemples d'exécution préprogrammés (par exemple : python example_1.py, sans qu'il soit nécessaire de saisir des paramètres).

Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)
    L'UE est acquise si note finale transposée >= C
    • Crédits ECTS acquis : 5 ECTS

    La note obtenue rentre dans le calcul de votre GPA.

    Pour les étudiants du diplôme Programmes d'échange internationaux

    Vos modalités d'acquisition :

    Modalités :

    - Vous devrez faire une présentation par groupe des deux projets pendant 30/40min pour les doubles/triplés. Vous pouvez organiser librement le temps de parole au sein d'un groupe et entre les projets.

    - Vous disposerez ensuite de 15/20min (doubles/triplets) de questions.

    - Aucun rapport écrit n'est attendu mais nous vous demandons de nous envoyer les slides de présentation (pdf) et les codes (sous forme de notebooks Jupyter ou Python pur, au choix) par email avant le mercredi 13 mars midi. Les cahiers/codes doivent également contenir des exemples de tests et une documentation suffisante.

    Nous avons essayé de prendre en compte les contraintes que nous connaissons, faites-moi savoir si cela ne fonctionne pas pour vous et nous essaierons de trouver une solution.

     

    Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)
      L'UE est acquise si note finale transposée >= C
      • Crédits ECTS acquis : 5 ECTS

      La note obtenue rentre dans le calcul de votre GPA.

      Veuillez patienter