Descriptif

Personalized Reconstitution of the Tumoral ProcessReconstitution Personnalisée du Processus Tumoral

Ce cours est entièrement réalisé dans le laboratoire d’Alexis Gautreau sur le campus. Vous serez supervisé par un chercheur post-doctorant très qualifié pour effectuer des expériences. Le sujet consiste à utiliser les données de Next Generation Sequencing de tumeurs de patients qui ont un cancer du sein invasif afin de transformer progressivement des cellules épithéliales mammaires normales en cellules cancéreuses pleinement invasives. L'originalité de cette approche est de n'utiliser que les gènes driver présents chez un unique patient pour tenter de récapituler le chemin de transformation et les caractéristiques tumorales de ce patient. Le projet implique de prédire les gènes driver à l'aide de la bioinformatique, de distinguer les mutations oncogènes de l'inactivation des gènes de suppresseur de tumeur, de cloner et d’exprimer des oncogènes mutés et d’éliminer les gènes suppresseurs de tumeur à l'aide de l'édition du génome (CRISPR-Cas9).

Il est souhaitable d'avoir suivi le cours BIO432 en Période 2 - Pathologies et stratégies thérapeutiques pour suivre le cours BIO572- Reconstitution Personnalisée du Processus Tumoral (RPPT). Merci de déclarer son intérêt auprès d'Alexis Gautreau. Encadrement au laboratoire, nombre de place limité.

Personalized Reconstitution of the Tumoral Process

This course is fully performed in the lab of Alexis Gautreau on campus. You will be supervised by a trained post-doctoral researcher to perform experiments. The topic is to use Next Generation Sequencing data of tumors from patients that we selected based on the fact that they display an invasive Breast Cancer in order to gradually transform normal mammary epithelial cells into fully invasive cancer cells. The originality of the approach is to use only the driver genes found in a single patient to try to recapitulate the transformation path and the tumor characteristics of this patient. The project involves driver prediction using bioinformatics, to distinguish oncogenic mutations from inactivation of tumor suppressor genes, to clone and express mutated oncogenes and to knock out tumor suppressor genes using CRISPR-mediated genome edition.

It is desirable to have taken the BIO432 course in Period 2 - Pathologies and Therapeutic Strategies to take the course BIO572 - Personalized Reconstitution of the Tumoral Process (RPPT). Thank's for
declare your interest to Alexis Gautreau. Supervision in the laboratory, limited space.