v2.11.0 (5518)

Parcours de domaine - PA-BIO : PA - Biologie

Domaine > Physique, Mécanique, Informatique, Chimie, Biologie.

Descriptif

Les sciences du vivant du xxie siècle bénéficient de deux avancées majeures :

La première est la mise à disposition d’outils pour le séquençage de nombreux génomes, ceux de microorganismes (bactéries,  levures,  etc.),  celui  de  l’homme, ceux d’animaux utilisés comme modèles expérimentaux : souris, drosophile… et ceux de végétaux.

La deuxième est la mise au point d’outils analytiques   et   d’imagerie   qui   se   sont développés  à  l’interface  entre  la  biologie et d’autres disciplines : informatique, physique, chimie. Les progrès réalisés ont été tels qu’il est maintenant possible d’intégrer les aspects moléculaires de la biologie jusqu’à  l’étude  des  écosystèmes,  en  passant par la cellule, l’organe et l’individu.

Le  programme  d’approfondissement  en Biologie proposé ici regroupe deux thématiques, qui approfondissent  chacune  un aspect particulier de ces avancées.

Ainsi on distinguera : la génomique  et  sesconséquences«Cellules, organismes, génomes, évolution» et les interfaces entrelabiologieetlesautresdisciplines « Biologie aux Interfaces ». Chaque thématique permet aux élèves du cycle ingénieur et aux étudiants de M1 de se familiariser avec les avancées les plus récentes de la biologie, qui révolutionnent les sciences et techniques du vivant tout en les imposant parmi les sciences de l’ingénieur.

Les deux thématiques, formant le programme, partagent plusieurs modules destinés à prolonger les enseignements de biologie d’année 2.

Ainsi sont présentés les mécanismes du développement des organismes vivants, ainsi que les outils de thérapies géniques et cellulaires qui découlent de la compréhension de ces mécanismes. Les applications et perspectives de la génomique (science des génomes) sont également présentées.

On découvre comment les génomes sont cartographiés et séquencés, comment les méthodes  bioinformatiques   permettent de convertir les données issues du séquençage en informations biologiquement pertinentes, et comment la génomique fonctionnelle permet la découverte des nombreux gènes impliqués dans les grandes fonctions physiologiques, chez l’homme  comme  dans  le  reste  du  règne vivant. Le système immunitaire et les pathologies associées sont également traités, ainsi que les applications thérapeutiques dans la lutte contre les maladies infectieuses.

Pour accompagner ces enseignements, les élèves sont invités à mettre en œuvre par eux-mêmes leurs connaissances, en réalisant un programme expérimental d’ingénierie génétique, comprenant éventuellement un volet d’imagerie quantitative. L’objectif  de  ces  travaux  expérimentaux est de confronter le futur ingénieur à quelques-unes  des  stratégies  d’exploitation et de reprogrammation des propriétés du vivant et de ses constituants.

Au deuxième trimestre les deux thématiques divergent, avec, d’un premier côté, une focalisation sur la génomique, et d’un second   côté,   l’introduction   d’enseignements d’interface avec d’autres disciplines.

Pré-requis

Au moins un module de Biologie en année 2

Composition du parcours

Unités d'enseignement

UE Type d'enseignement Domaines Catégorie d'UE Volume horaire Responsables Site pédagogique
BIO_50P11_EP Projet de 3e année de Biologie Programme d'approfondissement Biologie UE de projet, UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. Yves Mechulam,
Olivier Tenaillon
BIO_50P72_EP Reconstitution Personnalisée du Processus Tumoral (RPPT) Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO, UE d'approfondissement, UE de projet. Alexis Gautreau
BIO_51051_EP Immunologie et agents infectieux Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. David Ribet
BIO_51053_EP Biotechnologies pour la médecine et l'agriculture Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. Benoit Schneider,
Sébastien THOMINE
BIO_51055_EP Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes Programme d'approfondissement Biologie Maud Mouchet
BIO_51056_EP Génomes : diversité, environnement et santé humaine Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. Olivier Tenaillon
BIO_51057_EP Neurosciences Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. Valérie Ego-Stengel,
Xavier Nicol
BIO_51171_EP Travaux expérimentaux de génie génétique Programme d'approfondissement Biologie UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. Yves Mechulam
BIO_52001_EP Biologie des systèmes moléculaires Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. Meriem El Karoui
BIO_52002_EP Epigénétique et ARN non-codants Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. Claire Rougeulle,
Stéphan Vagner
BIO_52004_EP Biophotonique et applications Programme d'approfondissement Biologie Cédric Bouzigues
BIO_52064_EP Cancer immunotherapies Programme d'approfondissement Biologie
BIO_52101_EP Sciences des données en imagerie biologique Programme d'approfondissement Biologie UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. Anatole Chessel
BIO_52991_EP Biologie et écologie Stage Biologie Yves Mechulam
MDC_52P80_EP Projet de modélisation de systèmes vivants Programme d'approfondissement Mécanique, Biologie UE d'approfondissement. Arezki Boudaoud
MDC_52P88_EP Projet en bioinformatique Programme d'approfondissement Informatique, Biologie PA - BIOINF - cours/EA INF, UE de projet, UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Thomas Gaillard,
SEBASTIAN WILL
MDC_52068_EP Sciences du médicament Programme d'approfondissement Chimie, Biologie UE d'approfondissement. 36 Etienne FORMSTECHER,
Gilles Gasser,
Bastien Nay
MDC_52086_EP Biomécanique en santé et maladie Programme d'approfondissement Mécanique, Biologie UE d'approfondissement. Abdul Barakat
PHY_52065_EP Physique des systèmes vivants : fluctuations, auto-organi... Programme d'approfondissement Physique Raphaël Voituriez
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