Descriptif
Les approches de modélisation sont de plus en plus appliquées aux systèmes vivants. Ces approches servent à tester si un jeu d’hypothèses est suffisant pour expliquer le fonctionnement d’un système, à concevoir des méthodes pour agir sur ce système ou à suppléer à l’expérimentation lorsqu’elle est impossible. Ainsi, la majorité des domaines des sciences du vivant et de la bioingénierie sont concernés par la modélisation.
Ce module donnera aux étudiants un aperçu du domaine, à travers des cours et l’étude d’articles de recherche, et les amènera à la réalisation d’un projet de modélisation en petits groupes. Chaque groupe définira son sujet, proposera des hypothèses à partir de données expérimentales, formulera le modèle correspondant, le résoudra numériquement et discutera comment tester le modèle expérimentalement.
Objectifs pédagogiques
A la fin de ce cours, vous devriez savoir construire un modèle mathématique à partir d'une liste d'hypothèses biologiques, le résoudre numériquement et discuter ses prédictions à la lumière de données expérimentales. Vous devriez savoir travailler en groupe sur un projet de modélisation.
effectifs minimal / maximal:
/20Diplôme(s) concerné(s)
- Programmes d'échange internationaux
- M1 BH - Biologie et Santé
- M1 CI - Chimie et Interfaces
- Titre d’Ingénieur diplômé de l’École polytechnique
Parcours de rattachement
Pour les étudiants du diplôme Programmes d'échange internationaux
Formation d'ingénieur — au moins un module de biologie en année 2.
Master en biologie et santé — notions d’équations différentielles, d’algèbre, de probabilités et de programmation.
Pour les étudiants du diplôme Titre d’Ingénieur diplômé de l’École polytechnique
Cycle ingénieur — au moins un module de biologie en année 2.
Master en biologie et santé — notions d’équations différentielles, d’algèbre, de probabilités et de programmation.
Format des notes
Numérique sur 20Littérale/grade réduitPour les étudiants du diplôme M1 BH - Biologie et Santé
Vos modalités d'acquisition :
Pour un groupe de N étudiants
- Bref rapport écrit, sous forme de notebook Jupyter de préférence
- Présentation orale de 8xN minutes
- Questions pendant 4xN minutes
L'UE est acquise si Note finale >= 10
- Crédits ECTS acquis : 4 ECTS
Pour les étudiants du diplôme M1 CI - Chimie et Interfaces
L'UE est acquise si Note finale >= 10- Crédits ECTS acquis : 4 ECTS
Pour les étudiants du diplôme Programmes d'échange internationaux
Vos modalités d'acquisition :
Participation en classe (20%)
Projet - rapport et présentation (80%)
Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)- Crédits ECTS acquis : 5 ECTS
Pour les étudiants du diplôme Titre d’Ingénieur diplômé de l’École polytechnique
Vos modalités d'acquisition :
Participation en classe (20%)
Projet - rapport et présentation (80%)
Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)- Crédits ECTS acquis : 5 ECTS
La note obtenue rentre dans le calcul de votre GPA.
Programme détaillé
Thèmes couverts :
- Expression des gènes
- Biologie cellulaire
- Développement et pathologie
- Physiologie
- Ecologie et épidémiologie
- Evolution