v2.11.0 (6271)

Parcours de domaine - PA-BIO : PA - Biologie

Domaine > Biologie, Chimie, Mécanique, Informatique, Physique.

Descriptif

Les sciences du vivant du XXIe siècle bénéficient de deux avancées majeures : la première est la mise à disposition d’outils pour le séquençage de nombreux génomes, ceux de microorganismes (bactéries, levures, etc.), celui de l’homme, ceux d’animaux utilisés comme modèles expérimentaux: souris, drosophile… et ceux de végétaux. La deuxième est la mise au point d’outils analytiques et d’imagerie qui se sont développés à l’interface entre la biologie et d’autres disciplines : informatique, physique, chimie. Les progrès réalisés ont été tels qu’il est maintenant possible d’intégrer les aspects moléculaires de la biologie jusqu’à l’étude des écosystèmes, en passant par la cellule, l’organe et l’individu.

Objectifs

Le PA Biologie proposé ici regroupe deux thématiques qui approfondissent chacune un aspect particulier de ces avancées. Ainsi on distinguera : la génomique et ses conséquences « Cellules, organismes, génomes, évolution » et les interfaces entre la biologie et les autres disciplines « Biologie aux Interfaces ». Chaque thématique permet aux élèves du cycle ingénieur et aux étudiants de M1 de se familiariser avec les avancées les plus récentes de la biologie, qui révolutionnent les sciences et techniques du vivant tout en les imposant parmi les sciences de l’ingénieur.

Les deux thématiques formant le programme partagent plusieurs modules destinés à prolonger les enseignements de biologie d’année 2. Ainsi sont présentés les mécanismes du développement des organismes vivants, ainsi que les outils de thérapies géniques et cellulaires qui découlent de la compréhension de ces mécanismes. Les applications et perspectives de la génomique (science des génomes) sont également présentées.

On découvre comment les génomes sont cartographiés et séquencés, comment les méthodes bioinformatiques permettent de convertir les données issues du séquençage en  informations  biologiquement  pertinentes, et comment la génomique fonctionnelle permet la découverte des nombreux gènes impliqués dans les grandes fonctions physiologiques, chez l’homme comme dans le reste du règne vivant. Le système immunitaire et les pathologies associées sont également traités, ainsi que les applications thérapeutiques dans la lutte contre les maladies infectieuses.

Pour accompagner ces enseignements, les élèves sont invités à mettre en œuvre par eux-mêmes leurs connaissances, en réalisant un programme expérimental d’ingénierie génétique, comprenant éventuellement un volet d’imagerie quantitative. L’objectif de ces travaux expérimentaux est de confronter le futur ingénieur à quelques-unes des stratégies d’exploitation et de reprogrammation des propriétés du vivant et de ses constituants.

Au deuxième trimestre les deux thématiques divergent, avec, d’un premier côté, une focalisation sur la génomique, et d’un second côté, l’introduction d’enseignements d’interface avec d’autres disciplines.

Diplômes concernés

Compétences

Les enseignements de l'année 3 s'adressent aux élèves qui veulent explorer les propriétés du vivant de manière plus approfondie et à des niveaux croissants d'intégration, de la molécule à la cellule et aux organismes: génétique, reproduction, clonage, architecture et spéciation cellulaire, réseau de cellules en communication, ontogénèse du système nerveux, populations, génomique. Il s'agit, dans ces domaines, de fournir des connaissances opérationnelles en Biologie qui permettront aux élèves de continuer dans cette branche (voir ci-dessous).

Pré-requis

Au moins un module de Biologie en année 2

Composition du parcours

Unités d'enseignement

UE Type d'enseignement Domaines Catégorie d'UE Volume horaire Responsables Site pédagogique
BIO_50P11_EP Projet de biologie Programme d'approfondissement Biologie UE de projet, UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. Yves Mechulam,
Olivier Tenaillon
BIO_50P72_EP Biomédecine de précision du cancer Programme d'approfondissement Biologie UE de projet, UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Alexis Gautreau
BIO_51051_EP Immunologie et maladies infectieuses Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 David Ribet
BIO_51053_EP Biotechnologies pour la médecine et l'agriculture Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Benoit Schneider,
Sébastien THOMINE
BIO_51055_EP Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes Programme d'approfondissement Biologie UE de spécialité, UE de base. 36 Maud Mouchet
BIO_51056_EP Génomes : diversité, environnement et santé humaine Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Olivier Tenaillon
BIO_51057_EP Neurosciences Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Valérie Ego-Stengel,
Xavier Nicol
BIO_51171_EP Travaux expérimentaux en génie génétique Programme d'approfondissement Biologie UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. Yves Mechulam
BIO_52001_EP Biologie des systèmes moléculaires et Biologie synthétiqu... Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Meriem El Karoui
BIO_52002_EP Epigénétique et ARN non-codants Programme d'approfondissement Biologie PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Pablo Navarro,
Stéphan Vagner
BIO_52004_EP Biophotonique et applications Programme d'approfondissement Biologie 36 Cédric Bouzigues
BIO_52064_EP Immunothérapies contre le cancer Programme d'approfondissement Biologie 36 Eric Vivier
BIO_52101_EP Sciences des données de l'imagerie biologique Programme d'approfondissement Biologie UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO. 36 Anatole Chessel
BIO_52991_EP Stage Biologie et écologie Stage Biologie Yves Mechulam
MDC_52P88_EP Projet en bioinformatique Programme d'approfondissement Biologie, Informatique UE de projet, UE d'approfondissement, PA - BIOINF - cours/EA BIO, PA - BIOINF - cours/EA INF. 36 Thomas Gaillard,
SEBASTIAN WILL
MDC_52068_EP Sciences du médicament Programme d'approfondissement Biologie, Chimie UE d'approfondissement. 36 Etienne FORMSTECHER,
Gilles Gasser,
Bastien Nay
MDC_52086_EP Biomécanique en santé et en maladie Programme d'approfondissement Mécanique, Biologie UE d'approfondissement. 36 Abdul Barakat
PHY_52065_EP Physique des systèmes vivants : fluctuations, auto-organi... Programme d'approfondissement Physique 36 Raphaël Voituriez
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