Descriptif
Ce cours offre une introduction complète aux techniques de simulation moléculaire, en se concentrant sur les fondements théoriques et les applications pratiques des champs de force, de la dynamique moléculaire (DM) et des simulations Monte Carlo (MC). Les participants apprendront à analyser les systèmes moléculaires en phase condensée, à en extraire des informations dynamiques et structurales, et à mettre en place des simulations pour des systèmes simples.
Le cours aborde les principes et les limitations des méthodes de DM et MC, ainsi que les techniques d’échantillonnage avancé pour le calcul des énergies libres. À la fin du cours, les étudiants seront capables d’évaluer de manière critique des articles scientifiques sur les simulations moléculaires et d’appliquer ces méthodes à leurs propres recherches.
Objectifs pédagogiques
Objectifs d'apprentissage :
- maîtriser les notions de champs de forces pour le calcul de l'énergie d'un système moléculaire
- connaître les principes et limitations des simulations de dynamique moléculaire et Monte Carlo appliquées à l'étude de systèmes moléculaires
- analyser une simulation moléculaire pour en extraire des informations sur la dynamique et la structure d'un système
- mettre en place une simulation de dynamique moléculaire pour un système simple
- savoir appréhender un article de simulation moléculaire
Pour les étudiants du diplôme M2 CHI - Chimie et Interfaces
Mécanique classique du point; bases de mécanique quantique; thermodynamique classique; notions de thermodynamique statistique (facteur de Boltzmann)
Format des notes
Numérique sur 20Littérale/grade américainPour les étudiants du diplôme M2 CHI - Chimie et Interfaces
Vos modalités d'acquisition :
Format des notes
Numérique sur 20
Littérale/grade américain
Vos modalités d'acquisition :
Examen oral.
Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)
- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 7
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- Note initiale < 7
- Crédits ECTS acquis : 6 ECTS
La note obtenue rentre dans le calcul de votre GPA.
Programme détaillé
Programme/Plan/Contenus:
- Définition et principe des champs de forces
- Solvatation de systèmes moléculaires
- Simulations de dynamique moléculaire
- Simulations Monte Carlo
- Introduction aux méthodes d'échantillonnage avancé et calcul d'énergie libre