Descriptif
La biologie a été récemment transformée par notre capacité à quantifier les processus moléculaires à des échelles très différentes allant de molécules individuelles dans les cellules aux populations. Cette nouvelle capacité nous permet aussi de créer de nouvelles constructions biologiques synthétiques qui produisent de nouveaux médicaments ou détectent la présence de polluants.
Le cours abordera les bases moléculaires de l’expression des gènes et le contrôle des réseaux génétiques qui peuvent, en première approximation, être comparés à des circuits électriques. Les cellules sont des systèmes dynamiques et nous analyserons le type de réponse que l’on peut attendre de différent circuits génétiques en les comparant aux prédictions issues de modèle mathématiques simples. Nous discuterons les méthodes expérimentales qui permettent de comparer les modèles théoriques et les objets biologiques réels. Nous aborderons aussi les applications de la biologie de synthétique dans la vie de tous les jours et leurs implications éthiques et sociales.
Langue du cours : Anglais
Crédits ECTS : 4
Objectifs pédagogiques
Les principaux thèmes abordés seront :
- Quantifier les mécanismes cellulaires : méthodes et limitations.
- Régulation de l’expression des gènes.
- Croissance des bactéries et méthode quantitatives pour comprendre la résistance aux antibiotiques.
- Circuits génétiques et réseaux biologiques : oscillations et boucles de rétroaction in biologie.
- Re-codage et édition des génomes : CRISPR-cas9 et autres technologies. Applications de la biologie synthétique et implications sociales et éthiques des innovations.
effectifs minimal / maximal:
/50Diplôme(s) concerné(s)
- Programmes d'échange internationaux
- M1 Biologie et Santé
- Titre d’Ingénieur diplômé de l’École polytechnique
Parcours de rattachement
Pour les étudiants du diplôme Titre d’Ingénieur diplômé de l’École polytechnique
Vous devez avoir validé l'équation suivante : 1 parmi BIO451, BIO432, BIO431, BIO452
Format des notes
Numérique sur 20Littérale/grade réduitPour les étudiants du diplôme M1 Biologie et Santé
Pour les étudiants du diplôme Programmes d'échange internationaux
Vos modalités d'acquisition :
Examen oral en fin de période.
Soutenance en binôme 30 minutes réparties comme suit :
- 12 min de présentation de(s) l’article(s) incluant (i) une identification de la question et de son importance,
(ii) une présentation de la ou des solutions présentée(s) en relation avec le cours et (iii) une discussion critique des résultats présentés
- 15 min de questions/discussions autour de l’aricle et incluant des questions de cours
- Crédits ECTS acquis : 4 ECTS
Pour les étudiants du diplôme Titre d’Ingénieur diplômé de l’École polytechnique
Vos modalités d'acquisition :
Examen oral en binôme 30 minutes réparties comme suit :
Soutenance en binôme 30 minutes réparties comme suit :
- 12 min de présentation d'un modèle basé sur l'article que vous avez choisi (il existe deux options)
Lisez l'article, identifiez une question de recherche, rédigez un modèle (ou plusieurs modèles) pour répondre à VOTRE question et si possible analysez les résultats. Cela sera suivi de discussions de 15 minutes autour de l'article et les questions liées au cours.
Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)
- Crédits ECTS acquis : 5 ECTS
La note obtenue rentre dans le calcul de votre GPA.